对冠状病毒筛查患者的DNA测序可能会挽救生命

 
科学家应该开始对冠状病毒患者的基因组进行测序。我们应该寻找重症患者和轻症患者之间的DNA差异。这可以使我们预测谁还会受到攻击，并建议他们采取预防措施。在广泛使用疫苗之前，我们也许可以将这种知识用于冠状病毒的流行。
尤其重要的是，要知道关键的DNA变异是否由那些年轻但看起来健康但因冠状病毒而出现严重症状的稀有人群所共有。这样一来，我们便可以预测哪些医生和护士面临的风险最高，并将其从第一线撤离。
当然，我们还不知道是否可以进行准确的预测。我们甚至不知道某人的冠状病毒是否有导致严重症状的机会受到其基因的影响。但是，通过使用普通的DNA测序技术，我们可以相对便宜且快速地回答这些问题。
我们需要对需要重症监护的冠状病毒受害者的整个基因组进行测序，并将其与仅有轻度症状的人的基因组进行比较。每个类别只有几千个基因组，我们可以快速找出这种方法是否可行。
可能仅涉及一个或两个基因。也许破坏的基因参与了免疫系统或肺细胞表面。如果是这样，我们可以使用称为全基因组关联研究的方法快速发现它们。如果只有几个破损的基因能发挥作用，那么对冠状病毒易感性的基因检测就可以简单，便宜且准确地进行。
可能涉及数千种基因。也许是涉及肺生理，上呼吸道形状以及我们从未想过的许多其他事物的复杂基因组合。如果是这样的话，要弄清楚到底发生了什么，可能需要数十年的时间。但是我们需要在数周或数月之内得到答案。
受树木启发
在这里，我们可以利用出乎意料的灵感来源：可以使用一种称为“基因组预测”的方法，该方法已被动植物育种者成功使用了数十年，但很少用于医学领域。即使我们不了解任何基因在做什么，它也可以根据全基因组序列预测复杂的性状。
使用这种方法，我们不需要花费数年的时间来弄清楚到底发生了什么。我们可以从一个人的全基因组序列中构建一个得分，以预测其易感性。这些分数的获得(我们估计)仅为每人几百磅。
去年，我们对死于真菌流行病的白蜡树采取了基因组预测方法。通过比较健康树和濒死树的基因组，我们发现它们的基因组中有3,000多个点易感。其中一些是在宿主防御中具有已知功能的基因，但对于其他许多基因，我们不知道它们的作用。但是，我们不需要该知识就可以以有用的准确度来预测其他灰树的敏感性。
我们应该对人类和冠状病毒进行类似的研究。当然，隐私和同意的问题比我们处理灰树要复杂得多。但是，全世界已经有成千上万的人类基因组测序了，因此围绕同意的问题已经得到了很好的探讨。对于某些冠状病毒患者，他们的基因组已经存在于数据库中。
我们是否应该发现我们可以做出准确的预测，道德和心理挑战将是严峻的?测试应部署在哪里?如果人们预计自己有(或没有)危险，他们会做出适当的反应吗?它会如何影响健康保险?但是，在与病毒的斗争中我们必须做出的每个决定都面临着艰巨的挑战。
可以快速完成对冠状病毒易感性遗传基础的研究，而不会从治疗和疫苗研究中挪用资源。它可能表明预测是不可能的。它可能表明可以做出准确的预测。我们不知道但是我们需要找出答案。如果能奏效，它可能会在疫苗广泛普及之前保护数千人的生命。